Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) «Τεχνοοικονομική Διοίκηση & Ασφάλεια Ψηφιακών Συστημάτων» (Υ.Α. 137707/Β7, ΦΕΚ 574/Β΄/30-3-2009) απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (Μ.Δ.Ε.) στις κατευθύνσεις:
Δείτε τη δομή του Π.Π.Σ. και των Π.Μ.Σ. του Τμήματος σχηματικά.
Στην Κατεύθυνση της «Ασφάλειας Ψηφιακών Συστημάτων» παρέχεται η δυνατότητα στους φοιτητές να πιστοποιηθούν από αναγνωρισμένο φορέα, ως ISO 27001:2005 INFORMATION SECURITY MANAGEMENT SYSTEM (ISMS) AUDITOR, καθώς και να συμμετάσχουν σε προγραμματισμένους ελέγχους συμμόρφωσης επιχειρήσεων – οργανισμών ως προς ISO – 27000.