Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) «Τεχνοοικονομική Διοίκηση και Ασφάλεια Ψηφιακών Συστημάτων» (Υ.Α. 137707/Β7, ΦΕΚ 574/Β΄/30-3-2009) λειτουργεί από το ακαδημαϊκό έτος 2009-2010 και απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (Μ.Δ.Ε.) στην «Τεχνοοικονομική Διοίκηση και Ασφάλεια Ψηφιακών Συστημάτων» στις κατευθύνσεις:
Στην Κατεύθυνση της «Ασφάλειας Ψηφιακών Συστημάτων» παρέχεται η δυνατότητα στους φοιτητές να πιστοποιηθούν από αναγνωρισμένο φορέα, ως ISO 27001:2005 INFORMATION SECURITY MANAGEMENT SYSTEM (ISMS) AUDITOR, καθώς και να συμμετάσχουν σε προγραμματισμένους ελέγχους συμμόρφωσης επιχειρήσεων – οργανισμών ως προς ISO – 27000.